श्री करणी माताजी मंदिर अद्वितीय और दुनिया में अपनी तरह का एकमात्र मंदिर है। कई मायनों में यह मंदिर मानव-पशु सह-अस्तित्व और सद्भाव का प्रतीक है। कुछ लोगों को अजीब लग सकता है कि यह एक ऐसा मंदिर हैं जहाँ चूहे खुलेआम और बेरोकटोक घूमते हैं और चढ़ावे का स्वाद मानव भक्तों से पहले लेते हैं, लेकिन कुछ के लिए श्री करणी माताजी में सशक्त आस्था हर प्रश्न का उत्तर है।
आज जो करणी माता मंदिर दिखाई देता है, उसे 20वीं सदी की शुरुआत में महाराजा गंगा सिंह ने बनवाया था।

श्रद्धालु मानते हैं कि मंदिर में 25,000 से अधिक चूहे हैं जो चारण राजपूतों की पुण्य आत्माएँ हैं जिन्हें “कब्बा” के नाम से भी जाना जाता है।

यहाँ चूहों द्वारा आंशिक रूप से खाया गया प्रसाद पवित्र माना जाता है।

एक आश्चर्यजनक तथ्य यह है कि श्री करणी माता मंदिर के अंदर हज़ारों चूहों के उत्पात और यहाँ तक कि स्थानीय लोगों द्वारा चूहों के साथ साझा किए गए भोजन के बावजूद कभी भी प्लेग या किसी अन्य बीमारी की कोई घटना सामने नहीं आई है।

एक किंवदंती यह है कि मंदिर में रहने वाले हज़ारों चूहे सैनिक थे जो युद्ध के मैदान को छोड़कर भाग गए थे। उन्हें सज़ा के रूप में मृत्युदंड मिला, लेकिन करणी माता की कृपा के कारण उन्हें बचा लिया गया और वे मंदिर में चूहों के रूप में रहने लगे।

एक अन्य किंवदंती यह है कि करणी माता के पुत्र लक्ष्मण एक कुएँ से पानी पीने के बाद गिर गए और उनकी मृत्यु हो गई। करणी माता ने मृत्यु के देवता यम से उन्हें पुनर्जीवित करने की प्रार्थना की। यम इस शर्त पर सहमत हुए कि करणी माता और उनके वंशज चूहों के रूप में पुनर्जन्म लेंगे।

उल्लेखनीय बात यह है कि करणी माता मंदिर के अंदर हज़ारों चूहे रहते हैं, लेकिन वे मंदिर के मुख्य द्वार से बाहर कभी नहीं निकलते।

करणी माता मंदिर में यदि एक भी चूहा गलती से मर जाता है तो कहा जाता है कि उसके बदले ठोस सोने से बना उसी आकार का चूहा मंदिर को दान में दे कर प्रायश्चित्त करना चाहिए।

करणी माता मंदिर में साल में दो बार नवरात्रि के दौरान मेला लगता है, एक बार मार्च या अप्रैल के दौरान और फिर सितंबर या अक्टूबर के दौरान।

राजस्थान में करणी माता को समर्पित कई मंदिर हैं, लेकिन देशनोक में स्थित मंदिर चूहों वाला एकमात्र मंदिर है।
